PyMOL是一个由Schrödinger公司开发和维护的分子可视化软件,广泛用于生物化学、结构生物学和药物设计等领域。以下是PyMOL的一些主要特点和功能介绍:
1. 分子可视化
PyMOL 可以生成高质量的 3D 分子图像,展示蛋白质、核酸、配体和小分子的结构。用户可以通过旋转、缩放和平移等操作,方便地观察分子结构的各个角度。
2. 交互式操作
PyMOL 提供了丰富的交互工具,可以对分子进行实时操作。例如,用户可以选择、隐藏、着色和标记特定的原子、残基或分子部分,方便进行详细分析。
3. 图像和视频输出
PyMOL 可以生成高分辨率的图像和动画,用于演示和发表。它支持多种图像格式,并能生成电影文件,用于动态展示分子运动或模拟结果。
4. 脚本和自动化
PyMOL 具有强大的脚本功能,用户可以通过 Python 脚本进行自动化操作。这个功能特别适合需要处理大量分子或重复性任务的情况。
5. 插件支持
PyMOL 支持插件扩展,用户可以安装和开发各种插件,以增加 PyMOL 的功能。例如,有些插件可以进行特定的分子分析或与其他生物信息学工具进行集成。
6. 量子力学和分子动力学整合
作为 Schrödinger 产品的一部分,PyMOL 可以与 Maestro 等其他 Schrödinger 软件进行整合,支持量子力学计算、分子动力学模拟和药物设计工作流。
7. 用户社区和支持
PyMOL 拥有活跃的用户社区,提供了丰富的教程、文档和在线支持。此外,Schrödinger 公司还提供专业的技术支持和培训服务。
版本 | 日期 | 下载 |
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v3.0.3 | 2024/05/20 | 下载 |